MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 35774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018019	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
2	NC_018019	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399584
3	NC_018019	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	392399584
4	NC_018019	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399584
5	NC_018019	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	392399584
6	NC_018019	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399584
7	NC_018019	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399584
8	NC_018019	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	392399584
9	NC_018019	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399584
10	NC_018019	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	392399584
11	NC_018019	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	392399584
12	NC_018019	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399584
13	NC_018019	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399584
14	NC_018019	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399584
15	NC_018019	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	392399584
16	NC_018019	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	392399584
17	NC_018019	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	392399584
18	NC_018019	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	392399584
19	NC_018019	TGA	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
20	NC_018019	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399584
21	NC_018019	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
22	NC_018019	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
23	NC_018019	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	392399584
24	NC_018019	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	392399584
25	NC_018019	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
26	NC_018019	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399584
27	NC_018019	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399584
28	NC_018019	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
29	NC_018019	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	392399584
30	NC_018019	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	392399584
31	NC_018019	TGG	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399584
32	NC_018019	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	392399584
33	NC_018019	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
34	NC_018019	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
35	NC_018019	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399584
36	NC_018019	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399584
37	NC_018019	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399584
38	NC_018019	GAAG	2	8	2430	2437	50 %	0 %	50 %	0 %	392399585
39	NC_018019	CCCA	2	8	2485	2492	25 %	0 %	0 %	75 %	392399585
40	NC_018019	TAC	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399585
41	NC_018019	TCA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399585
42	NC_018019	GAT	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399585
43	NC_018019	GCT	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399585
44	NC_018019	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399585
45	NC_018019	CTGC	2	8	2770	2777	0 %	25 %	25 %	50 %	392399585
46	NC_018019	GCA	3	9	2830	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399585
47	NC_018019	TC	3	6	3006	3011	0 %	50 %	0 %	50 %	392399585
48	NC_018019	GCT	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399585
49	NC_018019	GAAA	2	8	3256	3263	75 %	0 %	25 %	0 %	392399585
50	NC_018019	CGG	2	6	3308	3313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399585
51	NC_018019	AGA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399585
52	NC_018019	TTAC	2	8	3399	3406	25 %	50 %	0 %	25 %	392399585
53	NC_018019	GAG	2	6	3493	3498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399585
54	NC_018019	TCGT	2	8	3684	3691	0 %	50 %	25 %	25 %	392399586
55	NC_018019	TTG	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399586
56	NC_018019	AT	3	6	3783	3788	50 %	50 %	0 %	0 %	392399586
57	NC_018019	TTG	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399586
58	NC_018019	GAT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399586
59	NC_018019	GAG	2	6	4390	4395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399586
60	NC_018019	TCA	2	6	4399	4404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399586
61	NC_018019	A	6	6	4464	4469	100 %	0 %	0 %	0 %	392399586
62	NC_018019	GAC	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399586
63	NC_018019	CGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399586
64	NC_018019	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399586
65	NC_018019	AAGG	2	8	4840	4847	50 %	0 %	50 %	0 %	392399586
66	NC_018019	CTG	2	6	4869	4874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399587
67	NC_018019	AGA	2	6	4885	4890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399587
68	NC_018019	TGC	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399587
69	NC_018019	GCG	2	6	4933	4938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399587
70	NC_018019	TC	3	6	4957	4962	0 %	50 %	0 %	50 %	392399587
71	NC_018019	A	6	6	5025	5030	100 %	0 %	0 %	0 %	392399587
72	NC_018019	CGG	2	6	5146	5151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399587
73	NC_018019	TGG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399587
74	NC_018019	A	6	6	5187	5192	100 %	0 %	0 %	0 %	392399587
75	NC_018019	AGC	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399587
76	NC_018019	AC	3	6	5200	5205	50 %	0 %	0 %	50 %	392399587
77	NC_018019	ATG	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399587
78	NC_018019	ATAC	2	8	5415	5422	50 %	25 %	0 %	25 %	392399587
79	NC_018019	CACGC	2	10	5736	5745	20 %	0 %	20 %	60 %	392399588
80	NC_018019	CGG	2	6	5771	5776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399588
81	NC_018019	ATGC	2	8	5817	5824	25 %	25 %	25 %	25 %	392399588
82	NC_018019	TGG	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399588
83	NC_018019	GGT	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399588
84	NC_018019	ACC	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399588
85	NC_018019	ACC	3	9	6099	6107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399588
86	NC_018019	CAT	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399588
87	NC_018019	CGT	2	6	6129	6134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
88	NC_018019	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
89	NC_018019	TGA	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
90	NC_018019	A	6	6	6262	6267	100 %	0 %	0 %	0 %	392399588
91	NC_018019	CCGATG	2	12	6274	6285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392399588
92	NC_018019	CTG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
93	NC_018019	GAA	2	6	6311	6316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
94	NC_018019	GAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
95	NC_018019	TTA	2	6	6338	6343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399588
96	NC_018019	TGA	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
97	NC_018019	TGA	2	6	6565	6570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
98	NC_018019	CG	3	6	6578	6583	0 %	0 %	50 %	50 %	392399588
99	NC_018019	AAAGAA	2	12	6600	6611	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	392399588
100	NC_018019	TCT	2	6	6819	6824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399588
101	NC_018019	GGC	2	6	6839	6844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399588
102	NC_018019	TGG	2	6	6890	6895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399588
103	NC_018019	ATT	2	6	7098	7103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399588
104	NC_018019	ATG	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
105	NC_018019	CAA	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399588
106	NC_018019	GCT	3	9	7211	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
107	NC_018019	TTG	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399588
108	NC_018019	CCG	2	6	7281	7286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399588
109	NC_018019	GAA	2	6	7359	7364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
110	NC_018019	CAA	2	6	7388	7393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399588
111	NC_018019	GAT	2	6	7395	7400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
112	NC_018019	ATG	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
113	NC_018019	TGA	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
114	NC_018019	TCG	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
115	NC_018019	T	6	6	7805	7810	0 %	100 %	0 %	0 %	392399589
116	NC_018019	TTC	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399589
117	NC_018019	GAG	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399589
118	NC_018019	AGC	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399589
119	NC_018019	TGC	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399589
120	NC_018019	GAG	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399589
121	NC_018019	AT	3	6	8128	8133	50 %	50 %	0 %	0 %	392399589
122	NC_018019	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399590
123	NC_018019	TGT	2	6	8593	8598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399590
124	NC_018019	CTG	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399590
125	NC_018019	GTC	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399590
126	NC_018019	GCG	2	6	8724	8729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399591
127	NC_018019	TGA	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399591
128	NC_018019	CGA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399592
129	NC_018019	GCG	2	6	9102	9107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399592
130	NC_018019	GAG	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399592
131	NC_018019	CCG	2	6	9235	9240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399592
132	NC_018019	ACG	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399592
133	NC_018019	CGC	2	6	9451	9456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399592
134	NC_018019	ACTC	2	8	9478	9485	25 %	25 %	0 %	50 %	392399592
135	NC_018019	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399592
136	NC_018019	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399592
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138	NC_018019	TCT	2	6	9681	9686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399592
139	NC_018019	GCAT	2	8	9731	9738	25 %	25 %	25 %	25 %	392399592
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142	NC_018019	CG	3	6	10047	10052	0 %	0 %	50 %	50 %	392399592
143	NC_018019	TGC	2	6	10158	10163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399592
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156	NC_018019	CTT	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399592
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258	NC_018019	T	6	6	16306	16311	0 %	100 %	0 %	0 %	392399598
259	NC_018019	GCA	2	6	16401	16406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399598
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385	NC_018019	CG	3	6	25414	25419	0 %	0 %	50 %	50 %	392399610
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